Con ImageMagick è possibile fare molte modifiche sulle immagini direttamente da line di comando.
Per convertire un file pdf in un file tif indicizzato a due colori (bianco e nero), che in GIMP richiede il passaggio tramite il caricamento del file pdf, (per quello che serve a me lo importo con risoluzione 300x300dpi), la trasformazione dell'immagine andando in Immagine > Modalità > Indicizzata e il salvataggio della stessa in tif.
Con ImageMagick tutto questo si traduce nel comando seguente:
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
convert -density 300x300 file.pdf -colors 2 -posterize 2 -type palette file.tif
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------